封面 书名页 版权页 第二版前言 第一版前言 致学生的一封公开信 致同行的一封公开信 目录页 第一章 绪论 第一节 分子生物学的起源 一、传递遗传学 二、分子遗传学 第二节 分子生物学的发展 一、DNA的半保留复制 二、基因与蛋白质之间的关系 三、“中心法则” 四、基因工程 Box 1-1 让“酵母君”酿造鸦片，你相信吗？ 五、分子生物学的其他进展 第三节 分子生物学学习方法 科学故事——朊病毒的发现 第二章 遗传物质的分子本质 第一节 遗传物质的分子本质 一、DNA是主要的遗传物质 二、RNA也可以作为遗传物质 三、某些蛋白质具有遗传物质的特性 第二节 核酸的结构 一、核酸的化学组成 Box 2-1 环状非编码RNA 二、核酸的一级结构 三、核酸的二级结构 Box 2-2 为何是DNA而不是RNA作为遗传信息的载体？ 四、核酸的三级结构 五、核酸与蛋白质形成的复合物 第三节 核酸的理化性质 科学故事——究竟是谁第一个发现了DNA的双螺旋结构？ 第三章 基因、基因组和基因组学 第一节 基因 一、对基因的认识 二、基因概念的扩展 Box 3-1 假基因，真表达，真功能 三、基因的种类和结构 四、基因的大小和数目 Box 3-2 我们究竟有多少个基因？ 五、基因簇与重复基因 第二节 基因组 一、病毒基因组 Box 3-3 大病毒、大惊喜 二、原核生物基因组 三、真核生物基因组 Box 3-4 线粒体夏娃 四、人类基因组 第三节 基因组学 一、结构基因组学 二、功能基因组学 Box 3-5 甲基化让人类和猴子分了家？ 三、生物信息学 科学故事——维生素C与假基因 第四章 DNA的生物合成 第一节 DNA复制 一、DNA复制的基本特征 Box 4-1 “生命字母表”的人工扩增 Box 4-2 冈崎令治与冈崎片段 二、DNA复制的酶学 三、DNA复制的详细机制 Box 4-3 线形DNA末端复制的难题的解决 四、DNA复制的高度忠实性 五、DNA复制的调控 第二节 逆转录 一、逆转录病毒的逆转录反应 Box 4-4 HIV辅助受体的发现 二、其他的逆转录反应 科学故事——DNA半保留复制的实验证明 第五章 DNA的损伤、修复和突变 第一节 DNA的损伤 一、导致DNA损伤的因素 二、DNA损伤的类型 第二节 细胞对DNA损伤做出的反应 Box 5-1 为什么某些哺乳动物不得或少得癌症？ 第三节 DNA的修复 一、直接修复 二、切除修复 Box 5-2 额外的DNA序列充当我们基因组的“备胎” Box 5-3 真核生物错配修复系统如何发现错配碱基？ 三、DSBR 四、损伤跨越（damage bypass） 五、一些与DNA修复缺陷有关的遗传性疾病以及修复缺陷与癌症之间的关系 第四节 DNA的突变 一、突变的类型与后果 二、突变的原因 Box 5-4 三聚核苷酸重复与脆性X染色体综合征 三、正向突变、回复突变与突变的校正 四、突变原与致癌物之间的关系以及致癌物的检测 科学故事——从癌蛋白到抗癌蛋白的角色转换 第六章 DNA重组 第一节 同源重组 一、同源重组的分子机制 二、细菌的同源重组 三、真核生物的同源重组 四、古菌的同源重组 第二节 位点特异性重组 一、λ噬菌体的位点特异性整合 二、鼠伤寒沙门氏菌鞭毛抗原的转换 Box 6-1 Cre-LoxP重组系统及其改造和应用 第三节 转座重组 一、细菌的转座子 二、真核生物的转座子 Box 6-2 睡美人转座子的复活 三、古菌的转座子 四、转座的分子机制 Box 6-3 谁偷走了人的DNA？ 五、转座作用的调节 科学故事——“跳跃基因”的发现 第七章 RNA的生物合成 第一节 DNA转录 一、转录的一般特征 二、催化DNA转录的RNA聚合酶 Box 7-1 植物细胞RNAPⅣ的发现故事 三、RNAP的三维结构与功能 四、细菌的DNA转录 五、真核生物的核基因转录 Box 7-2 细胞的记忆机制 六、真核生物细胞器DNA的转录 七、古菌DNA的转录 第二节 RNA复制 Box 7-3 RNA重组 一、双链RNA病毒的RNA复制 二、单链RNA病毒的RNA复制 Box 7-4 蝙蝠抵抗病毒和长寿的秘密 科学故事——人类和酵母居然如此相似！ 第八章 转录后加工 第一节 细菌RNA前体的后加工 一、mRNA前体的后加工 二、rRNA前体的后加工 三、tRNA前体的后加工 第二节 真核细胞RNA前体的后加工 一、mRNA前体的后加工 Box 8-1 CTD密码 Box 8-2 剪接体是核酶吗？ Box 8-3 次要剪辑途径也重要 二、rRNA前体的后加工 Box 8-4 “RNA世界”的探索之旅 三、tRNA前体的后加工 第三节 古菌的转录后加工 科学故事——第一例真正的核酶的发现 第九章 蛋白质的生物合成 第一节 参与翻译的各种生物大分子的结构与功能 一、核糖体 二、mRNA 三、tRNA 四、氨酰tRNA合成酶 Box 9-1 tRNA的新功能——衍生于tRNA的促癌小RNA的发现 五、辅助蛋白因子 第二节 翻译的一般性质 一、均可分为氨基酸的活化、起始、延伸和终止四个阶段 二、翻译具有极性 三、三联体密码 四、反密码子决定特异性 五、摆动规则 第三节 翻译的详细机制 一、细菌的翻译 Box 9-2 改造大肠杆菌的编码系统 二、真核生物的细胞质翻译系统 三、细胞器翻译系统 四、古菌的翻译系统 第四节 翻译的质量控制 一、细菌的翻译质量控制 二、真核生物的翻译质量控制 三、古菌翻译系统的质量控制 第五节 再次程序化的遗传解码 一、翻译水平的移框 二、通读 三、跳跃翻译 四、硒代半胱氨酸和吡咯赖氨酸的参入 第六节 翻译的抑制剂 一、细菌翻译系统的抑制剂 二、真核生物翻译系统的抑制剂 三、既抑制细菌又抑制真核生物翻译系统的抑制剂 科学故事——RNA领带俱乐部与遗传密码的破译 第十章 蛋白质的翻译后加工、分拣、定向和水解 第一节 翻译后加工 一、多肽链的剪切和修剪 二、N端添加氨基酸 三、蛋白质剪接 四、个别氨基酸残基的修饰 五、形成二硫键 六、添加辅助因子 七、多肽链的折叠 Box 10-1 霍乱毒素的胞内之乱 八、四级结构的形成 第二节 蛋白质翻译后的定向与分拣 Box 10-2 “分子邮政编码”的发现 一、共翻译途径 二、翻译后途径 第三节 细胞内蛋白质的选择性降解 一、真核生物细胞内的蛋白质降解系统 二、细菌细胞内的蛋白质降解系统 三、古菌细胞内的蛋白质降解系统 科学故事——7SL RNA的发现 第十一章 原核生物的基因表达调控 第一节 正调控与负调控 第二节 在DNA水平上的调控 一、基因的拷贝数 二、启动子的强弱 三、DNA重排 第三节 在转录水平上的调控 一、转录起始阶段的调控 Box 11-1 古菌的色氨酸操纵子 二、转录终止水平上的调控——终止与抗终止 第四节 在翻译水平上的调控 一、反义RNA 二、核开关 三、自体调控 四、mRNA的降解 五、mRNA的二级结构与基因表达的调控 Box 11-2 RNA温度计 第五节 环境信号诱发的基因表达调控 一、严紧反应 Box 11-3 TA系统的威力 二、CRISPR-Cas系统 三、二元基因表达调控系统 四、群体感应 第六节 在基因组水平上的全局调控 一、调节子 二、噬菌体基因表达的时序控制 科学故事——乳糖操纵子发现历程 第十二章 真核生物的基因表达调控 第一节 在染色质水平上的基因表达调控 一、组蛋白的化学修饰对基因表达的影响 二、染色质重塑因子对基因表达的影响 三、组蛋白变体对基因表达的影响 四、lncRNA对基因表达的影响 第二节 在DNA水平上的基因表达调控 一、DNA扩增 二、DNA重排 三、基因丢失 四、DNA甲基化 Box 12-1 DNA的第六个碱基 五、DNA印记 Box 12-2 父亲吃啥可通过DNA甲基化影响到你！ 六、多个启动子的选择性使用 第三节 在转录水平上的基因表达调控 一、顺式作用元件 Box 12-3 增强子RNA 二、转录因子 三、参与转录水平调节的lncRNA 四、转录水平调控的实例 Box 12-4 能将老鼠变成蛇吗？ 五、转录后加工水平上的基因表达调控 六、在mRNA运输水平上的调控 七、翻译水平上的调控 Box 12-5 正义和反义RNA之间的较量 Box 12-6 类病毒的致病机制 八、翻译后水平的调节 科学故事——RNAi的发现 第十三章 分子生物学方法 第一节 重组DNA技术简介 一、基因克隆的载体 二、将外源基因或序列导入载体的工具 三、宿主细胞 四、将重组DNA引入到宿主细胞的途径 五、重组体的选择和筛选 第二节 重组DNA技术的详细步骤 一、外源DNA序列和目的基因的获得 二、目的基因与载体的连接 三、重组DNA导入特定的宿主细胞 四、含有目的基因序列的克隆的筛选和鉴定 第三节 重组DNA技术的应用 一、文库的建立 二、DNA序列分析 三、表达外源蛋白 四、转基因动物、植物及转基因食品 五、基因治疗 六、研究基因的功能 七、寻找未知基因 第四节 聚合酶链式反应 一、RT PCR 二、反向PCR 三、巢式PCR 四、递减PCR 五、原位PCR 六、菌落PCR 七、简并PCR 八、多重PCR 九、不对称PCR 十、热不对称交错PCR 十一、标记PCR 十二、实时定量PCR 第五节 蛋白质工程 一、随机突变 二、定点突变 Box 13-1 胰岛素的定向改造 第六节 研究核酸与蛋白质之间相互作用的主要方法和技术 第七节 研究蛋白质之间相互作用的主要方法和技术 一、免疫共沉淀 二、亲和层析 三、共价交联 四、荧光共振能量转移 五、生物发光共振能量转移 六、酵母双杂交 第八节 SELEX技术 第九节 生物芯片技术 一、基因芯片 二、蛋白质芯片 第十节 基因组编辑技术 一、大范围核酸酶 二、锌指核酸酶 三、拟转录激活蛋白效应物核酸酶 四、Cas9 Box 13-2 CRISPR技术进军基因治疗 科学故事——绿色荧光蛋白的发现和发展 专业词汇英汉对照和索引 常见英文缩写 主要参考书目 推荐网站 ..更多