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R语言在基因组分析中的应用
暂无评分 作者:梅步俊著 出版社:中国农业科学技术出版社 出版日期:2019年11月 ISBN:978-7-5116-4430-5 中图分类:Q78 ( 生物科学 > 分子生物学 > 基因工程(遗传工程) )
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封面 书名页 版权页 前言 目录 绪论 概率与数理统计简介 一、随机现象和随机试验 二、样本空间与事件 三、古典概型 四、条件概率和事件的独立性 第一章 数量遗传学基础 第一节 基因频率和基因型频率 第二节 遗传效应和遗传差异 第三节 平均等位基因替代效应 第四节 遗传方差组分 第五节 遗传力 第六节 哈代-温伯格平衡条件下的F_(2)家系 第七节 模拟基因型分布 第八节 哈代-温伯格比例检测 第二章 统计基因组学中的作图函数和重组率 第一节 Mapping函数与重组 一、物理图谱和遗传图谱 二、作图函数的推导 三、Haldane作图函数 四、Kosambi作图函数 第二节 重组率 一、交配设计 二、重组率的最大似然估计 三、标准误差和显著性检验 四、估计r期望极大化算法(EM) 五、多点方法计算缺失基因型的概率 第三节 作图函数的导出 一、推导必备的积分知识 二、 Haldane作图函数 三、Kosambi作图函数 四、Haldane作图函数的另一种推导方式 第三章 R语言入门 第一节 R语言简介 一、R语言的特点 二、R语言的缺点 三、重要概念:CRAN 第二节 应用举例 第三节 R语言的数据操作 一、R语言与工作目录 二、改变工作目录 三、函数与对象 第四节 R语言统计学基础 一、t检验 二、方差分析 第五节 导入CSV、TXT文件 一、read.table函数 二、scan函数 三、readxl包 四、RODBC包(只适用于Windows) 五、XLConnect包 第六节 R语言中生成虚拟变量/哑变量 练习 第四章 R语言绘图 第五章 R语言应用于生物统计 一、方差检验 二、多水平多重复数据如何读取 三、相关性分析 四、回归分析 五、多元线性回归分析 六、变量选择与最优回归 七、Logistic回归 练习 封底 ..更多
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