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Q 生物科学
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Q7 分子生物学
R语言在基因组分析中的应用
暂无评分
作者:梅步俊著
出版社:中国农业科学技术出版社
出版日期:2019年11月
ISBN:978-7-5116-4430-5
中图分类:Q78 ( 生物科学 > 分子生物学 > 基因工程(遗传工程) )
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封面
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前言
目录
绪论 概率与数理统计简介
一、随机现象和随机试验
二、样本空间与事件
三、古典概型
四、条件概率和事件的独立性
第一章 数量遗传学基础
第一节 基因频率和基因型频率
第二节 遗传效应和遗传差异
第三节 平均等位基因替代效应
第四节 遗传方差组分
第五节 遗传力
第六节 哈代-温伯格平衡条件下的F_(2)家系
第七节 模拟基因型分布
第八节 哈代-温伯格比例检测
第二章 统计基因组学中的作图函数和重组率
第一节 Mapping函数与重组
一、物理图谱和遗传图谱
二、作图函数的推导
三、Haldane作图函数
四、Kosambi作图函数
第二节 重组率
一、交配设计
二、重组率的最大似然估计
三、标准误差和显著性检验
四、估计r期望极大化算法(EM)
五、多点方法计算缺失基因型的概率
第三节 作图函数的导出
一、推导必备的积分知识
二、 Haldane作图函数
三、Kosambi作图函数
四、Haldane作图函数的另一种推导方式
第三章 R语言入门
第一节 R语言简介
一、R语言的特点
二、R语言的缺点
三、重要概念:CRAN
第二节 应用举例
第三节 R语言的数据操作
一、R语言与工作目录
二、改变工作目录
三、函数与对象
第四节 R语言统计学基础
一、t检验
二、方差分析
第五节 导入CSV、TXT文件
一、read.table函数
二、scan函数
三、readxl包
四、RODBC包(只适用于Windows)
五、XLConnect包
第六节 R语言中生成虚拟变量/哑变量
练习
第四章 R语言绘图
第五章 R语言应用于生物统计
一、方差检验
二、多水平多重复数据如何读取
三、相关性分析
四、回归分析
五、多元线性回归分析
六、变量选择与最优回归
七、Logistic回归
练习
封底
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